在2018年的怪物《怪物弹珠 第三季》中，主人公焰莲回到了熟悉的弹珠第季神之原街道，却感受到一种莫名的怪物违和感。他确实在这里住过，弹珠第季但对那段时光的怪物记忆完全空白。这一切的弹珠第季背后，是怪物智能手机上突然出现并进入现实世界的《怪物弹珠》游戏，以及从游戏中飞出的弹珠第季怪物们，为他的怪物生活带来了巨大的变化。焰莲在与这些怪物战斗的弹珠第季过程中，逐渐发现了自己体内沉睡的怪物记忆碎片，并揭开了一个关于怪物弹珠背后的弹珠第季巨大谜团。与此同时，怪物焰莲遇到了三位重要的弹珠第季伙伴：水泽葵、影月明和若叶皆实。怪物他们各自肩负着不同的使命——葵正在寻找修复被扭曲天界的钥匙；明则来自另一个平行世界，有着不为人知的秘密；而皆实则是守护者之一，拥有着阻止灾难的关键能力。在与路西法和乌列尔这对昔日好友的对峙中，焰莲逐渐意识到，自己不仅需要面对怪物弹珠背后的真相，还要对抗即将来临的巨大危机。随着故事的发展，他将如何利用手中的钥匙、解开体内记忆的谜团，并最终集结起属于自己的弹珠联盟？这一切，都在等待着他去探索和解答。