在宁静的萌宠小镇上，一系列神秘盗窃案频发，特工让居民们惶恐不安。萌宠一只名叫米咪的特工小猫咪决心成为大侦探，便毅然离家出走。萌宠在旅途中，特工她遇到了一位自以为风度翩翩却有点滑稽的萌宠公鸡、渴望成为马戏团明星的特工毛驴以及一只对人类充满敌意的守门狗。起初，萌宠四只性格迥异的特工小动物之间摩擦不断，但随着时间推移，萌宠他们逐渐学会了相互理解与信任。特工就在他们即将解开盗窃谜团之际，萌宠一场误会让他们被错误地指控为真凶。特工面对困境，萌宠四人决定团结一致，用智慧和勇气证明自己的清白，并最终揭开真相的面纱。这场冒险不仅考验着他们的友情与勇气，更让每个人都找到了自我成长的机会。在欢笑与泪水交织的故事中，《萌宠特工队》将带领观众一同经历一段难忘旅程，在寻找正义的过程中收获了意想不到的成长与启示。