在某一天，蜡笔小新（矢岛晶子 配音）意外地从河堤上捡到了一瓶神秘液体，小新并误将其带回家并放在冰箱里。呐喊这瓶液体后来被美伢（楢桥美纪 配音）和广志（藤原启治 配音）无意中喝下，春日结果两人在一夜之间变成了动物。部野一觉醒来的生王小新发现这一反常现象后，立即意识到事情的蜡笔严重性，并决定采取行动。小新原来，呐喊一个神秘环保组织SKBE为了推进激进的春日环保理念，计划通过一种测试中的部野药物将破坏环境的人类全部变成动物。而小新捡到的生王那瓶液体正是这种药物的一部分。为阻止这个计划，蜡笔小新在神秘女子维多利亚（后藤邑子 配音）的小新帮助下与春日部防卫队携手合作。为了营救美伢和广志，呐喊并揭开SKBE背后的阴谋，小新等人踏上了一段充满挑战的冒险旅程。他们不仅要应对各种动物形态的变化带来的困扰，还要面对组织成员的步步紧逼。在这个过程中，一系列出人意料的情节不断上演，令观众在欢笑与惊险中见证友情与勇气的力量。最终，在一系列精彩的探险和斗争后，小新等人成功揭露了四膳守（山寺宏一 配音）的阴谋，并解救了被俘获的家庭成员。影片不仅展现了孩子之间的纯真友谊，同时也传递出环保意识的重要性。