在二十一世纪末的魔法现代，魔法早已不再是科高神话传说中的神秘存在。它与科学和超能力交融并存，魔法成为人类社会的科高一部分。为此，魔法各国纷纷建立了专门培养魔法人才的科高学院，以便更好地为国家服务。魔法《魔法科高校的科高劣等生》以东京某所魔法高校为背景，讲述了新生司波达也（中村悠一 配音）与妹妹司波深雪（早见沙织 配音）在这里的魔法生活。深雪是科高拥有“花冠”称号的能力出众的学生，而达也成为其后备的魔法“杂草”。二人在学校的科高日常生活中结识了许多性格各异的朋友：千叶艾丽卡（内山夕实 配音），一个直率开朗的魔法女孩；柴田美月（佐藤聪美 配音），文静且略带胆怯的科高新成员；西城雷欧哈鲁特（寺岛拓笃 配音），勇敢正直，魔法常常挺身而出保护他人；以及吉田干比古（田丸笃志 配音），虽然性格内向但勤奋好学。在学习魔法的过程中，达也和深雪逐渐揭开了学校背后的秘密，并与这些朋友一起共同面对挑战。这部作品以轻松幽默的风格，展示了魔法世界的多样性和同学们之间的深厚情谊。