1998年的紫雨风暴夏天，香港海域上空突然传来激烈的紫雨风暴枪声。一支由北韩雇佣军组成的紫雨风暴队伍与一群赤柬恐怖分子在此展开了一场生死较量。战斗中，紫雨风暴一名名为多特（吴彦祖饰）的紫雨风暴赤柬成员不幸受伤并陷入失忆状态。为了不让他成为潜在威胁，紫雨风暴香港警方将他送入医院进行治疗。紫雨风暴与此同时，紫雨风暴反恐怖组织指挥官马力（周华健饰）接到了这一案件，紫雨风暴并迅速采取行动。紫雨风暴经过一番技术攻关，紫雨风暴马力成功破解了多特身上的紫雨风暴磁盘文件。文件中揭示了一个惊人的紫雨风暴秘密：赤柬头目食客（甘国亮饰）与关艾（何超仪饰）联手策划了一场毁灭性的阴谋——他们将利用生化武器制造紫雨，一旦紫雨弥漫整个香港，紫雨风暴这座繁华的紫雨风暴城市将成为死城。马力深知事态的严重性，决定联合心理专家Shirley（陈冲饰），共同设计一个策略。他试图让失忆中的多特相信自己是警方派出的卧底，并成功打入食客内部。然而，在多次接触中，多特逐渐恢复了记忆，开始陷入身份认同危机。此时，食客再次提出威胁：要么交出多特，要么面临更严重的后果。多方权衡后，一场关乎生死的较量即将展开……